Modalità STRUTTURA: menù a torta degli strumenti.
La modalità Struttura è un set di strumenti che permette al giocatore di manipolare la struttura secondaria della proteina.
All'inizio del gioco il puzzle presenta delle strutture secondarie(foglietti β, α eliche e congiunzioni) che non sono "reali" ma solo frutto di convenzioni o valutazioni fatte su strutture proteiche simili. Non è assolutamente detto che la proteina abbia realmente quelle strutture secondarie: il gioco permette quindi di modificarle e forzarle a essere qualcosa di diverso. Si può quindi, ad esempio, imporre alla sequenza di amminoacidi che forma un foglietto β di assumere una conformazione a elica rompendo i suoi legami a idrogeno; se si è ottenuta un configurazione finale più stabile, il punteggio del puzzle aumenterà, altrimenti diminuirà.
E' altrettanto comune, per esempio, modificare le strutture secondarie in una lunga serie di congiunzioni per poter applicare più facilmente lo strumento Wiggle localmente. O trasformare eliche e foglietti per poter applicare a piacimento lo strumento Tweak. Il gioco non sembra preoccuparsi molto di come si voglia configurare queste strutture secondarie, inoltre si può sempre premere CTRL+"E" per tornare alla loro forma precedente.
A volte il puzzle inizia senza alcuna struttura secondaria e sarà il giocatore a definirle completamentes. A volte è utile costruire eliche o foglietti ma non è obbligatorio.
Gli strumenti possono essere selezionati in Modalità struttura cliccando con il pulsante destro del mouse sulla sezione su cui si vuole intervenire: si aprirà un menù a forma di torta con le varie opzioni.
- α Eliche (Helix)
- Foglietti β (Sheet)
- Congiunzioni (Loop)
Ognuno di questi strumenti è discusso in un apposito articolo, questo perché sono troppo diversi tra di loro per essere affrontati unitariamente.
La Modalità Struttura è selezionabile dal menù Modes direttamente sulla schermata di gioco.
Selezione della Modalità STRUTTURA.