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Glycine G.jpg

Rappresentazione della GLICINA in FoldIt

La Glicina (G) è spesso annoverata tra gli amminoacidi idrofobici pur non possedendo alcun gruppo laterale. Questa assenza del gruppo laterale le permette di legarsi agli altri amminoacidi con angolazioni decisamente estreme; infatti in corrispondenza della Glicina si hanno spesso delle inversioni di direzione della catena di amminoacidi. Questa caratteristica gioca un ruolo chiave nel permettere alla proteina l'assunzione di varie conformazioni senza eccessivo sforzo.

NoteModifica

  • Quando si ruota una sezione della proteina o si usa lo strumento Tweak, è vantaggioso includere anche la Glicina più vicina alla sezione interessata perché è probabile che questa ruoti più facilmente proprio grazie alla flessibilità della Glicina. La mossa ha molte più probabilità di riuscire.
  • Se un amminoacido che causa un punteggio basso è legato ad una Glicina, allora la situazione si può migliorare seguendo questa tattica:
    • Bloccate i due amminoacidi alle loro estremità.
    • Utilizzate lo strumento Wiggle localmente. Se l'amminoacido deve il suo basso punteggio al fatto di essere legato in un modo che non gli si addice, questa mossa trasferisce alcuni dei suoi legami alla Glicina, che spesso gli accetta. La mossa dovrebbe aumentare il punteggio complessivo.


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