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Trascinare Collisioni

Trascinando il ramo di sinistra verso il resto della proteina, questa si compatta ma si creano delle collisioni tra gruppi laterali.

Questo è sicuramente il più semplice strumento di FoldIt da capire, e anche quello che probabilmente verrà utilizzato di più, eccetto forse il "Wiggle".

Per trascinare una parte della proteina è sufficiente entrare in Modalità pull, cliccare con il pulsante sinistro del mouse su un amminoacido e spostarlo dove si vuole sullo schermo. L'amminoacido andrà dove voi volete. Le altre parti della proteina ad esso connesse si sposteranno in un modo che è legato alla loro flessibilità, alla loro posizione iniziale e agli ostacoli che incontreranno lungo la strada (altre parti della catena).


Spesso questo strumento porta alcuni gruppi laterali ad essere troppo vicini tra loro (collisioni); la soluzione è quella di scuotere un po' i gruppi laterali (Shake sidechains) oppure quella di muovere un po' tutta la struttura (Wiggle). Di fatto il trascinamento è raramente usato da solo, per aumentare il punteggio si dovrà per forza mettere riparo ai problemi che ha generato.


Le proteine hanno delle zone più flessibili e altre meno: le prime tendono a curvare maggiormente, a creare cioè angoli molto acuti con le altre parti dello scheletro della proteina. Se si nota che diverse mosse di trascinamento generano delle collisioni sempre nelle stesse zone, allora si è arrivati probabilmente al limite di utilità di quella mossa, meglio considerare altri strumenti di gioco.